Tutkijat kiirehtivät oppimaan lisää koronaviruksen epidemiologiasta ja geneettisestä sekvenssistä, joka leviää nopeasti Aasiassa ja sen ulkopuolella. Samaan aikaan ihmisillä ei ole tehokkaita lääkkeitä koronavirusinfektioiden hoitamiseksi, samoin kuin sertifioituja rokotteita niiden estämiseksi ei ole.
Terveysviranomaiset ympäri maailmaa ovat huolissaan salaperäisen viruksen puhkeamisesta, joka ilmeni viime kuussa Kiinan Wuhan-kaupungissa. Paikalliset viranomaiset ovat vahvistaneet yli 500 tartuntatapausta, joka aiheuttaa hengityselinsairauksia ja 17 kuolemaa. Useita tapauksia on ilmoitettu muualla Aasiassa ja yksi Yhdysvalloissa.
Tutkijat kiirehtivät tutkimaan virusta yksityiskohtaisemmin selvittääkseen, voiko se laukaista vakavan akuutin hengitysteiden oireyhtymän (SARS) epidemian, joka koski eteläistä Kiinaa vuosina 2002-2003 ja tappoi 774 ihmistä 37 maassa. Molemmat virukset kuuluvat valtavaan koronavirusten perheeseen, johon sisältyy yleinen kylmä.
Taudinpurkauksen luonteen ymmärtäminen on erityisen tärkeää, koska massiivinen matkustaminen perjantaista kiinalaiseen uuteen vuoteen uhkaa nopeuttaa viruksen leviämistä edelleen.
Kuinka virus leviää?
Kiireellisin kysymys on viruksen leviäminen. Kiinan viranomaiset ovat vahvistaneet, että jotkut tapauksista johtuvat henkilöiden välisestä välityksestä, mutta onko edelleen epäselvää, tapahtuuko tämä säännöllisesti.
"On tärkeää ymmärtää, onko leviämisen nopeus ja tehokkuus epidemian tasolla", kertoo Neil Ferguson, Lontoon Imperial College -nimistön matemaattinen epidemiologi. Uusien tapausten ja oireiden puhkeamisen seuraaminen tapauskohtaisesti kertoo tutkijoille, kuinka helposti virus leviää henkilöiden välillä ja onko tautipesäke mahdollista jatkaa.
Mainosvideo:
Kuinka tappava se on?
Aluksi tutkijat kuulivat hälytyksen Wuhan-viruksen tappavuudesta, koska ensimmäisten tartunnan saaneiden joukossa oli monia vakava keuhkokuumetapauksia. Mutta lievempien tapausten ilmestyminen hajotti joitain pelkoja. Kun viruskuolemia oli 17 yli 500 tapauksessa, virus ei vaikuta olevan yhtä tappavaa kuin SARS, joka tappoi noin 11% tartunnan saaneista. Mutta on "liian aikaista" optimistisille arvioille, Ferguson sanoi.
Mistä hän tuli?
Viranomaiset kehittelevät teoriaa, jonka mukaan virus on peräisin tuntemattomasta eläimestä ja levisi sitten ihmisille suurilla Wuhanin eläin- ja äyriäistuotteiden markkinoilla. Viruksen eläinperäisen lähteen tunnistaminen auttaa tutkimaan nykyisen puhkeamisen hallinnassa ja arvioimaan sen uhan asianmukaisesti, samalla kun estetään vastaavat epidemiat tulevaisuudessa. Geneettinen sekvensointi viittaa siihen, että Wuhan-virus liittyy linkki lepakoiden kuljettamiin koronaviruksiin - mukaan lukien SARS ja sen lähisukulaiset. Kuitenkin myös muut nisäkkäät kantavat näitä viruksia, ja on todennäköistä, että SARS-tartunta tapahtui ihmisille eläinsissististä (alias sivetti).
Nyt suljetuilla markkinoilla - joilla puhkeaminen näyttää alkavan - myytiin myös villieläimiä. Hongkongin yliopiston epidemiologin Ben Cowlingin mukaan samankaltaisten tapausten jäljittäminen markkinoilla sekä markkinoilta saatavien eläinten ja niiden astioiden ja solujen analysointi tartunnan saaneen geneettisen materiaalin suhteen auttavat määrittämään lähteen.
Mitä tiedämme viruksen geneettisestä sekvenssistä?
Wuhan-koronaviruksen geneettinen sekvensointi antaa käsityksen sen alkuperästä ja levinneisyydestä. Kiinan ja Thaimaan laboratoriot ovat sekvensoineet ainakin 19 tartunnan saaneista ihmisistä löydetyn kannan genomit ja asettaneet ne julkisesti saataville. "Tämä on erinomainen tapaus, kun otetaan huomioon, että työn alkamisesta on kulunut vain kaksi viikkoa", sanoo syöpätutkimuskeskuksen evoluutiogeneetikko Trevor Bedford. Fred Hutchinson Seattlessa, Washingtonissa. Se analysoi sekvenssejä niiden tullessa sisään. "He tekevät hienoa työtä ja ovat erittäin nopealla kommunikoinnilla", hän lisää.
Pysäytä Wuhan-virus
Bedford sanoo, että sekvenssien silmiinpistävin asia on kuinka samankaltaiset ne ovat toisiinsa.”Erilaisuutta on hyvin vähän. Odotin enemmän ja mielestäni myös muita. Geneettisen monimuotoisuuden puute viittaa siihen, että erilaisten ihmiskantojen yhteinen esi-ikä ilmestyi marraskuussa tai joulukuussa ja levisi nopeasti ilman paljon aikaa muuntamiselle. Hankitut mutaatiot ovat erilaisia jokaisella virussekvenssillä. Bedford lisää kuitenkin, että genomista ei ole vielä mahdollista päätellä, onko se levinnyt nopeasti ihmisten kesken vai eläinkuntaan. Samankaltaiseen johtopäätökseen pääsi evoluutiogeneetti Andrew Rambaut Iso-Britannian Edinburghin yliopistosta, joka julkaisi analyysinsä 20. tammikuuta.
Bedfordin mukaan uusien virussekvenssien avulla voidaan päätellä, johtuvatko useimmat tapaukset viruksen uudelleen leviämisestä eläimistä ihmisille, joilla on rajoitettu leviäminen ihmisestä toiseen, vai leviävätkö virus alun perin pienelle määrälle ihmisiä, ja suurin osa nykyisistä tapauksista johtuu toissijaisesta leviämisestä ihmisestä toiseen. "Uskon, että siitä tulee epidemiologien päätavoite ympäri maailmaa", hän sanoo. Niiden eläinten geneettiset tiedot, joista virus on levinnyt ihmisille, auttavat määrittämään leviämisasteen, Bedford toteaa.
Kuinka nopeasti Wuhan-virus leviää?
Lisäksi hän sanoo, että tällaiset sekvenssit auttavat määrittämään geneettiset muutokset, jotka aiheuttivat viruksen leviämisen eläimistä ihmisiin. Ja jos puhkeaminen jatkuu laajan ihmisen leviämisen vuoksi, Bedford ja muut geneetikot etsivät merkkejä lisämutaatioista, jotka tekevät viruksesta tehokkaamman leviämisen ihmisten keskuudessa.
Samalla Bedford varoittaa, että nämä päätelmät ovat puhtaasti alustavia, koska tietoja ei ole tarpeeksi. "Tilanne muuttuu huomattavasti, jos joukko ydinnäytteitä lisätään", hän sanoo.
Onko parannuskeino koronavirukselle?
On osoitettu, että ihmisillä ei ole tehokkaita lääkkeitä SARS: n tai muiden koronavirusinfektioiden hoitamiseksi, eikä niiden estämiseksi ole varmennettuja rokotteita.
Ryhmä Pekingin uusien lääkkeiden tutkimuksen kansallisen tutkimuskeskuksen työntekijöitä kehittää hoitoja estämällä ihmisen solujen reseptoreita, joiden kautta tartunta tapahtuu. SARS: n ja 16. tammikuuta julkaistujen uusien kiinalaisten virusten sekvenssivertailu osoitti, että ne sitoutuvat samaan reseptoriin. Ryhmä odottaa jatkavansa SARS-hoitojen käsittelyä ja mukauttaakseen ne viimeisimmän viruksen torjuntaan.
Ewen Callaway, David Cyranoski