Tutkijat ovat löytäneet uuden viruksen Brasiliasta, jonka DNA on 90 prosenttia geeneistä, joita tiede ei tunne. Löytön tulokset julkaistaan bioRxiv-esitulostuksessa.
Virus havaittiin Pampulha-keinotekoisesta järvestä Brasilian Belo Horizonten kaupungissa. Sen ei kovin monimutkainen genomi koostuu lähes kokonaan geeneistä, joita tiede ei tunne. Kirjoittajat nimittivät uuden viruksen Yaravirus brasiliensis Etelä-Amerikan kansojen mytologiasta peräisin olevan vesinimpun Yara mukaan.
Tutkijat arvaavat, että heillä on edessään ensimmäinen tapaus tuntemattomasta eristetystä virusryhmästä tai jättiläisviruksen kaukaisesta lajista, joka on kehittynyt pienemmäksi.
Vain 2000-luvulla löydetyt jättiläisvirukset ovat kooltaan verrattavissa bakteerisoluihin. He saivat nimensä valtavien kapsiidien - virionikapseloivien proteiinikalvojen - vuoksi - viruspartikkelit. Heillä on myös sopivan pituinen DNA, joka ylittää 200 tuhatta emäsparia ja sisältää usein niin kutsuttuja orpo- tai orpogeenigeenejä (ORFan), joita ei löydy mistään muusta organismiryhmästä.
Kompleksit genomit antavat jättiläisille viruksille mahdollisuuden syntetisoida proteiineja ja siten suorittaa DNA: n korjaus, replikaatio, transkriptio ja translaatio. Ennen niiden löytämistä uskottiin, että viruksilla ei ole sellaisia kykyjä, koska ne ovat inerttejä olentoja, jotka voivat tartuttaa vain isäntiään. Kaikki tunnetut jättiläisvirukset ovat amebien loisia.
Ja vaikka uuden mikro-organismin koko on huomattavasti pienempi kuin jättiläisvirusten - noin 80 nanometriä -, se loistauduttaa myös amoebassa, ja sen genomi on melkein kokonaan orpo: 68 geenistä (yli 90 prosenttia) ei löydä analogia yhdestäkään tunnetusta organismista ja vain kuusi epämääräisesti samanlainen kuin tieteen tiede.
"Tämä johtuu siitä, että virus on uusi ameroebiviruksen linja, jolla on hämmästyttävä alkuperä ja fylogeenisuus", sanoi yksi tutkimuksen vetäjistä, Jônatas Abrahão Brasilian Minas Geraisen liittovaltion yliopistosta, lehdistötiedotteessa.
Tutkijat ovat analysoineet yli kahdeksan ja puoli tuhatta metagenomia, mutta eivät ole löytäneet heidän joukostaan viruksia, jotka liittyvät uuteen mikro-organismiin. Kuten muutkin tämän ryhmän virukset, sitä edustaa kaksijuosteinen DNA, jonka pituus on 44 900 emäsparia ja sisältää 74 koodaavaa fragmenttia.
Mainosvideo:
"Käyttämällä standardiprotokollia, aivan ensimmäisessä geenianalyysissamme ei onnistunut havaitsemaan yaraviruksessa mitään tunnistettavia kapsiidisekvenssejä tai muita klassisia virusgeenejä", selittää Yonatas Abrajao ja toisen tutkimuksen johtaja Bernard La Scola Aix-Marseille-yliopistosta Ranska.
Virallisten metagenomisten protokollien mukaan yaravirusta ei voida edes tunnistaa viruksen aiheuttajiksi, koska sillä ei ole selvää samankaltaisuutta niiden kanssa. Tutkijat eivät voi vielä sanoa, mikä hän todella on - täysin uuden ryhmän edustaja tai jättiläisviruksen jälkeläinen, joka jotenkin kehittyi pienempään muotoon.
"Yaraviruksen hiukkasten muodostavien tuntemattomien proteiinien lukumäärä heijastaa virusmaailmassa esiintyvää vaihtelua ja sitä, kuinka monta uutta virusgenomia on vielä löydetty", kirjoittajat päättävät.