Inkvisitio kirkon instituutiona alkaa toimintansa vuodesta 1215. Silloinen paavi Innocent III, joka hyväksyi inkvisiittorien perusoikeudet ja -velvollisuudet, liittyy suoraan katolisen kirkon erityistuomioistuimen perustamiseen. On syytä todeta, että niin sanottujen "harhaoppisten" tunnistaminen ja vainoaminen alkoi melkein kristillisen uskonnon syntymisen ensimmäisistä vuosista ja jatkuu tietysti tähän päivään asti, ei niin hienostuneessa ja radikaalissa muodossa kuin keskiajalla. Varhaiskristillinen kirkko pakotettiin epätoivoiseen taisteluun paitsi ulkoisten vastustajien (pääasiassa Rooman keisarien henkilöiden) kanssa, myös sisäisten ristiriitojen kanssa. Loputtomat kiistat korkeimman kristityn papiston edustajien välillä tiettyjen tekstien pyhyysasteesta ja erimielisyydet niiden tulkinnassa johtivat lopultatiettyjen yhtenäisten pappismalleja koskevien sääntöjen luomiseen. Perustuen Pyhän Paavalin apostoliseen opetukseen ja Johannes Teologian ilmoituksiin piispat toivat esiin kaikille kristityille yhteisen "todellisen uskon" opin, julistaen kaikille, jotka eivät noudattaneet sen kaanoneja, keisariksi ja "kadonneiksi".
Kristinuskon kynnyksellä luopuneen enimmäisrangaistus oli ekskommunikaatio. Ensimmäinen tapaus harhaoppisen omaisuuden hylkäämisestä papin hyväksi kirjattiin vuonna 316. Muutamia vuosikymmeniä myöhemmin, vuonna 385, ensimmäinen harhaoppi tuomittu kuolemantuomiosta suoritettiin. Kristitty kirjailija ja filosofi Priscillian teloitettiin useiden hänen opinsa seuraajien kanssa. He kaikki poltettiin vaakalaudalla; ei ole tarpeetonta todeta, että Priscillian saarnasi askeesia, joka ei estänyt "todellisen uskon" tytöitä saattamasta hänet kivuliaan kuolemaan.
Yhdestoista vuosisadan alusta lähtien harhaoppisten vaino ja tuhoaminen alkoivat saada massahahmoa. Kuuluisan Frederick Barbarossan (1120 - 1190) aikana kehitettiin ja otettiin käyttöön järjestelmä uskonnon vastaisten rikosten havaitsemiseksi. Hänen mukaansa kirkkoon sopimattomasta käytöksestä tuomitut olivat kirkon tuomioistuimen alaisia. Samaan aikaan irtisanomista käytettiin laajalti ja rohkaistiin etenkin varakkaiden kansalaisten kohdalla, joiden omaisuus päätyi aina kirkon kassaan. Lopuksi, vuonna 1229, paavi Gregory yhdeksäs perustaa todellisen kirkon tuomioistuimen, jonka tarkoituksena on "tunnistaa, estää ja rangaista harhaoppia". Myöhemmin, vuonna 1478, tämä oikeuslaitos muutettiin ns. "Espanjan inkvisitioksi", joka on yksi radikaaleimmista ja hirveimmistä uskonnollisen obskuranssin muodoista.
Vastoin yleistä uskoa, inkvisitit itse eivät käytännössä koskaan osallistuneet suoraan harhaoppimisesta syytettyjen teloituksiin. Heidän tehtävänsä oli pohjimmiltaan selvittää tietyn epäillyn syyllisyys tai viattomuus. Syytettyjä kohdeltiin valtaosassa tapauksissa hienostunutta kidutusta yrittäen napata tunnustuskirjaa harhaoppisista harjoitteluista ja vakaumuksista. Jos "harhaoppinen" ei kuollut kidutuksen aikana, tunnusti kirkkoa koskeviin rikoksiin ja teki niistä parannuksen, hänelle määrättiin kirkon rangaistus (rangaistus). Jos syytetty edelleen kiisti syyllisyytensä tai hyväksyi vain yhden syytteen kohdan ja hylkäsi muut, hänet tunnustettiin "itsepäiseksi harhaoppiseksi" ja hänet annettiin maalliseen tuomioistuimeen. Täten,inkvisiittorit kiistivät vastuun heille lankeneen käden tulevasta kohtalosta ja eivät muodollisesti vaatineet hänen tuomitsemistaan. Tähän oikeudelliseen menettelyyn liittyi kuitenkin maallisten viranomaisten halu "rangaista ansioiden mukaan", mikä riitautti syytetyn toivosta sakkojen lieventämisestä.
Inkvizitio osallistui kuuluisaan "noitametsästykseen", joka alkoi viidennentoista vuosisadan lopulla. Niinä päivinä Eurooppaa pyyhkäisi hysteeriaalto, joka liittyi huhuihin "paholaisen palvelijoiden" massiivisesta läsnäolosta ja "sopimuksesta Luciferin kanssa" väestön keskuudessa. Oikeudenmukaisuudessa on todettava, että vaikka inkvisitio oli mukana noitien tunnistamisessa, suurin osa kuolemantuomioista annettiin maallisissa tuomioistuimissa ilman hänen osallistumista.
Inkvisiittorit eivät sallineet tuomion antamista ilman oikeudenkäyntiä, mutta samaan aikaan melkein koskaan oikeuttamaan. Harhaoppia syyttävä henkilö oli ennakolta syyllinen, etenkin jos hänen omaisuutensa oli arvokasta kirkon miehille. Tästä syystä pyhä Espanjan inkvisitio riehui etenkin Euroopan varakkaille alueille tuhoamalla ja tuomitsemalla varakkaiden kaupunkien, maanviljelijöiden ja kauppiaiden tulipalo syyttämällä heitä jumalanpilkosta ja pahan hengen palvonnasta. Samanaikaisesti todistajien suulliset todistukset olivat riittäviä syytteiden nostamiseksi, ja heille tarjottiin pieni palkkio irtisanomisesta, joka otettiin syytetyn takavarikoidusta omaisuudesta.
Mainosvideo:
Virheellisten tietojen mukaan Espanjan inkvisition uhrien lukumäärä on koko sen toiminnan ajan ylittänyt kolmesataa neljäkymmentätuhatta ihmistä, joista noin kolmekymmentäkaksi tuhatta poltettiin elossa. Yli seitsemäntoista tuhatta poltettiin kuristumisen jälkeen, loput kidutettiin, vangittiin ja muut rangaistukset. Vähitellen inkvisitiolaitos tuhoutui melkein kaikissa Euroopan maissa, mukaan lukien Espanja (vuonna 1834) ja Portugali (vuonna 1820), joissa sen vaikutusvalta oli erityisen vahva. Tällä nimellä toiminut organisaatio oli pisimpään Roomassa, vasta vuonna 1908 Pyhän Kansliaryhmän pyhän seurakunnan nimi nimettiin uudelleen.