Apollon lennoille kudottiin usein jotain salaperäistä. Apollo 12: n mukana oli kaksi valaisevaa ufoa sen kolmen kiertoradan aikana ympäri kuuta. Apollo 13 -operaatio epäonnistui täysin. Kuussa salaperäiset valot alkoivat kummittaa häntä. Huhtikuussa 13. huhtikuuta 1970 räjähti odottamattomasti happisäiliö, ja astronauttien oli luovuttava kuun laskeutumisesta Fra Mauron kraatteriin.
On olemassa versio siitä, että happisäiliö räjäytettiin UFO: n toimesta, mikä estää amerikkalaisia tuomasta atomipommia Kuuhun seismistä tutkimusta varten. Tämän onnettomuuden seurauksena astronautit onnistuivat vain suurilla vaikeuksilla pääsemään matalan maan kiertoradalle ja palaamaan kotiplaneetalleen. Apollo 15 -matkalla havaittiin valtava UFO, joka lensi hitaasti kuun pinnan yli. Lopuksi Apollo 16: n komentaja John Young löysi kuukausipölystä siistin lasiprisman, jonka arvioitiin olevan miljardeja vuosia.
Vuonna 1996 Yhdysvalloissa julkaistiin Apollo 17 -hankkeen tekijöistä tohtori Edwin Raisin kirja "Kadonnut tila". Rais väitti, että tällä retkellä astronautit tapasivat tiettyjä kuun asukkaita. Matkustaessaan planeettamme satelliitin pinnalla Roverilla he väittivät törmänneen pieneen, noin kolmen jaardin kupolirakenteeseen, josta yhtäkkiä kaatoi noin tusina outoa olentoa. He eivät yrittäneet hyökätä ajoneuvoa vastaan, mutta se lakkasi yhtäkkiä tottelemasta astronautteja. Samaan aikaan heidän kuulokkeissaan kuului selkeä, kuulostava puhe, joka välitettiin Houstoniin, jossa se käännettiin nopeasti latinaksi.
Kävi ilmi, että olennot kertoivat astronauteille, että he olivat tunkeutuneet vieraalle alueelle ja että heidän pitäisi mennä kotiin. Heti kun kaikki ja kaikki ymmärsivät, hallinta Roverin suhteen palautui, ja maanmiehet ryntäsivät kuun laskeutuvaan ajoneuvoonsa.